Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms