Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms