Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RfxankQ9Z205 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RfxankQ9Z205 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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