Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nme3Q9WV85 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nme3Q9WV85 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms