Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcd6ipQ9WU78 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdcd6ipQ9WU78 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdcd6ipQ9WU78 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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