Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Wdr54Q9R0D8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Wdr54Q9R0D8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms