Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gpc6Q9R087 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gpc6Q9R087 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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