Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms