Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gpc1Q9QZF2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gpc1Q9QZF2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms