Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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