Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Csnk1eQ9JMK2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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