Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfmbt1Q9JMD1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms