Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms