Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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