Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms