Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ybx3Q9JKB3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms