Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gpa33Q9JKA5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms