Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lmbr1Q9JIT0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lmbr1Q9JIT0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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