Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL4

Pdzk1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1Q9JIL4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1Q9JIL4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1Q9JIL4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzk1Q9JIL4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1Q9JIL4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdzk1Q9JIL4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Pdzk1Q9JIL4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pdzk1Q9JIL4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms