Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Trim39Q9ESN2 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim39Q9ESN2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms