Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ush1cQ9ES64 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms