Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp29Q9ES63 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms