Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clstn2Q9ER65 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms