Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Hmgn3Q9DCB1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hmgn3Q9DCB1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmgn3Q9DCB1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmgn3Q9DCB1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmgn3Q9DCB1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmgn3Q9DCB1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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