Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SrpraQ9DBG7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms