Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms