Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Snx5Q9D8U8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms