Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp5Q9D7S9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms