Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms