Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcc1Q9D4H2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms