Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf128Q9D304 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf128Q9D304 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms