Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snx20Q9D2Y5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snx20Q9D2Y5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Snx20Q9D2Y5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx20Q9D2Y5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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