Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9D2Q3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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