Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pramef12Q9D2F1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pramef12Q9D2F1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pramef12Q9D2F1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pramef12Q9D2F1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Pramef12Q9D2F1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pramef12Q9D2F1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms