Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl53Q9D1H8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms