Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx17Q9D0I4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx17Q9D0I4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx17Q9D0I4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stx17Q9D0I4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Stx17Q9D0I4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms