Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ChtopQ9CY57 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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