Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pfdn1Q9CWM4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pfdn1Q9CWM4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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