Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lhfpl3Q9CTN8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms