Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim8Q9CQQ0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim8Q9CQQ0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms