Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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