Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rwdd1Q9CQK7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms