Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf2Q9CQJ4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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