Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Atp6v0e1Q9CQD8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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