Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prpf8Q99PV0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms