Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GpnmbQ99P91 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms