Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf2ird2Q99NI3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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