Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ubqln4Q99NB8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms