Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hdac9Q99N13 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hdac9Q99N13 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms