Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Spef1Q99JL1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Spef1Q99JL1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Spef1Q99JL1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Spef1Q99JL1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Spef1Q99JL1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spef1Q99JL1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms